福建专升本毕业证与普通本科毕业证的不同体现在证书标注和学制上，但是学历性质是相同的。
1.证书标注不同
福建专升本毕业证会在显著位置标注“专科起点升本科”或“专科起点二年制本科学习”等字样，明确体现其培养路径为专科后衔接本科。而普通本科毕业证无此类标注，直接显示“四年制本科”等常规表述。
2.学制体现不同
专升本毕业证的“学制”栏通常注明“专科起点二年制”，反映其实际学习年限为专科3年加本科2年(部分医学类专业为3年)。普通本科毕业证则按常规学制标注为“四年制”或“五年制”。
3.学历性质与效力相同
尽管标注有别，两者均为国家承认的全日制本科学历，具有同等法律效力，在考研、考公、就业等方面享有相同待遇。学位证也与普通本科完全一致，无任何差异。
总结：福建专升本毕业证与普通本科毕业证的核心区别在于证书标注和学制体现，但学历含金量和法律效力完全相同，不影响后续发展。